产品介绍
文库制备是目标序列捕获或测序之前的一个必要步骤，可将起始 DNA 或 RNA 转变为最终文库（图 1）。我们的文库制备解决方案综合完备，能帮助您在各种研究应用中取得满意结果，适用范围涵盖：
- DNA 测序（全基因组测序和靶向测序）
- RNA 测序（全转录组测序和靶向测序）
- 甲基化测序（全基因组测序和靶向重亚硫酸盐测序）
- 染色质免疫共沉淀 (ChIP) 测序
- 杂交捕获靶向测序
- 无需 PCR 的工作流程
- 肿瘤研究
- 宏基因组学研究
所有 xGen 文库制备试剂盒均适合自动化处理。
所有 xGen 文库制备试剂盒均兼容 xGen Normalase™ 模块。这种专有技术是一种新型酶切文库均一化方法，使用后无需进行文库浓度调整即可测序。
图 1. 使用制备文库的工作流程示例。 在这一示例中，制备好的文库被用于杂交捕获实验，得到的测序样本可用于各种 Illumina® 平台。
使用下列表格选择最适合您研究的 xGen 文库制备试剂盒。
表 1. 可供选择的 IDT xGen DNA 文库制备试剂盒及各自优势。
| xGen DNA 文库制备试剂盒 | xGen cfDNA & FFPE DNA 文库制备试剂盒 | xGen ssDNA 和低起始量 DNA 文库制备试剂盒 | |
|---|---|---|---|
| 核心优势 | 面向高质量样本（如 gDNA、宏基因组学样本，高质量 FFPE）的 DNA 文库制备试剂盒 | 面向低起始量或困难样本（如 FFPE、cfDNA）的高转化率文库制备试剂盒 | 面向低质量降解 DNA、ssDNA 或 ssDNA-dsDNA 混合样本的文库制备试剂盒 |
| 工作流程类型 | 无需 PCR + PCR 扩增 | PCR 扩增 | PCR 扩增 |
| 片段化 | 机械剪切和酶切片段化选项 | 机械切割 | 机械切割 |
| 起始量 (ng) | 机械剪切：1 ng 到 1 µg 酶切：100 pg 到 1 µg |
1 ng 到 250 ng | 10 pg 至 250 ng |
| 错误校正选项 (UMI) | 单 read 系列，使用 UDI-UMI 接头 | 单 read 和组合 read 系列（试剂盒内置 UMI） | 无 |
表 2. 可供选择的 IDT xGen RNA 文库制备试剂盒及各自优势。
| xGen RNA 文库制备试剂盒 | xGen 广谱 RNA 文库制备试剂盒 | |
|---|---|---|
| 核心优势 | 快速的工作流程 | 广泛的起始量范围 |
| 起始材料 | 5 ng 到 100 ng（mRNA、rRNA 去除 RNA、总 RNA） 100 ng 到 500 ng（总 RNA 用于制备文库以供杂交捕获） 100 ng 到 1 µg（总 RNA 制备文库用于上游模块*） |
100 pg–100 ng（mRNA、rRNA 去除 RNA、总 RNA） 10 ng–1 µg（总 RNA 制备文库用于上游模块*） |
| 样本类型 | 核糖体 RNA 去除 RNA Poly(A) 富集 mRNA 总 RNA 福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) RNA |
核糖体 RNA 去除 RNA Poly(A) 富集 mRNA 总 RNA 福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) RNA DV200 分数较低的 RNA |
| 所需时长** | 约 3.5 小时 | 约 4.5 小时 |
*注：本试剂盒不提供 rRNA 去除模块和 poly(A) 富集模块。
**此处给出的工作流程时长基于完成每个步骤的标准方法。由于各实验室内部规程不同，结果可能有所差异。
表 3. xGen 甲基化测序文库制备试剂盒的特点
| xGen 甲基化测序 DNA 文库制备试剂盒 | |
|---|---|
| 核心优势 | 采用 xGen Adaptase 技术，全面覆盖表观遗传学研究所用的甲基化组* |
| DNA 起始量 | 100 pg 至 100 ng |
| 应用 | 全基因组重亚硫酸盐测序 (WGBS) 靶向重亚硫酸盐测序（使用 xGen 杂交捕获探针组） 单细胞重亚硫酸盐测序 在相关研究中鉴别全基因组范围的 cfDNA 甲基化 |
| 所需时长** | 约 2 小时 |
*注：xGen Adaptase 技术是一种不依赖模板的接头连接方法，不但能降低工作流程耗时，生成的文库偏倚也更低。
**此处给出的工作流程时长基于完成每个步骤的标准方法。由于各实验室内部规程不同，结果可能有所差异。