IDT埃德特 文库制备和接头xGen™ NGS

产品介绍

文库制备是目标序列捕获或测序之前的一个必要步骤,可将起始 DNA 或 RNA 转变为最终文库(图 1)。我们的文库制备解决方案综合完备,能帮助您在各种研究应用中取得满意结果,适用范围涵盖:

  • DNA 测序(全基因组测序和靶向测序)
  • RNA 测序(全转录组测序和靶向测序)
  • 甲基化测序(全基因组测序和靶向重亚硫酸盐测序)
  • 染色质免疫共沉淀 (ChIP) 测序
  • 杂交捕获靶向测序
  • 无需 PCR 的工作流程
  • 肿瘤研究
  • 宏基因组学研究

所有 xGen 文库制备试剂盒均适合自动化处理。

所有 xGen 文库制备试剂盒均兼容 xGen Normalase™ 模块。这种专有技术是一种新型酶切文库均一化方法,使用后无需进行文库浓度调整即可测序。

IDT埃德特 文库制备和接头xGen™ NGS

图 1. 使用制备文库的工作流程示例。 在这一示例中,制备好的文库被用于杂交捕获实验,得到的测序样本可用于各种 Illumina® 平台。

使用下列表格选择最适合您研究的 xGen 文库制备试剂盒。

 

表 1. 可供选择的 IDT xGen DNA 文库制备试剂盒及各自优势。

  xGen DNA 文库制备试剂盒 xGen cfDNA & FFPE DNA 文库制备试剂盒 xGen ssDNA 和低起始量 DNA 文库制备试剂盒
核心优势 面向高质量样本(如 gDNA、宏基因组学样本,高质量 FFPE)的 DNA 文库制备试剂盒 面向低起始量或困难样本(如 FFPE、cfDNA)的高转化率文库制备试剂盒 面向低质量降解 DNA、ssDNA 或 ssDNA-dsDNA 混合样本的文库制备试剂盒
工作流程类型 无需 PCR + PCR 扩增 PCR 扩增 PCR 扩增
片段化 机械剪切和酶切片段化选项 机械切割 机械切割
起始量 (ng) 机械剪切:1 ng 到 1 µg
酶切:100 pg 到 1 µg
1 ng 到 250 ng 10 pg 至 250 ng
错误校正选项 (UMI) 单 read 系列,使用 UDI-UMI 接头 单 read 和组合 read 系列(试剂盒内置 UMI)

表 2. 可供选择的 IDT xGen RNA 文库制备试剂盒及各自优势。

  xGen RNA 文库制备试剂盒 xGen 广谱 RNA 文库制备试剂盒
核心优势 快速的工作流程 广泛的起始量范围
起始材料 5 ng 到 100 ng(mRNA、rRNA 去除 RNA、总 RNA)
100 ng 到 500 ng(总 RNA 用于制备文库以供杂交捕获)
100 ng 到 1 µg(总 RNA 制备文库用于上游模块*)
100 pg–100 ng(mRNA、rRNA 去除 RNA、总 RNA)
10 ng–1 µg(总 RNA 制备文库用于上游模块*)
样本类型 核糖体 RNA 去除 RNA
Poly(A) 富集 mRNA
总 RNA
福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) RNA
核糖体 RNA 去除 RNA
Poly(A) 富集 mRNA
总 RNA
福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) RNA
DV200 分数较低的 RNA
所需时长** 约 3.5 小时 约 4.5 小时

*注:本试剂盒不提供 rRNA 去除模块和 poly(A) 富集模块。

**此处给出的工作流程时长基于完成每个步骤的标准方法。由于各实验室内部规程不同,结果可能有所差异。

 

表 3. xGen 甲基化测序文库制备试剂盒的特点

  xGen 甲基化测序 DNA 文库制备试剂盒
核心优势 采用 xGen Adaptase 技术,全面覆盖表观遗传学研究所用的甲基化组*
DNA 起始量 100 pg 至 100 ng
应用 全基因组重亚硫酸盐测序 (WGBS)
靶向重亚硫酸盐测序(使用 xGen 杂交捕获探针组)
单细胞重亚硫酸盐测序
在相关研究中鉴别全基因组范围的 cfDNA 甲基化
所需时长** 约 2 小时

*注:xGen Adaptase 技术是一种不依赖模板的接头连接方法,不但能降低工作流程耗时,生成的文库偏倚也更低。

**此处给出的工作流程时长基于完成每个步骤的标准方法。由于各实验室内部规程不同,结果可能有所差异。

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