产品介绍
什么是扩增子测序?
扩增子测序是一种靶向二代测序 (NGS) 实验方法,让您可以研究特定基因组区域的序列。该方法使用 PCR 为您复制靶向 DNA 序列,以生成扩增子。典型的 PCR 实验只有一组上游和下游引物,与之不同,扩增子测序探针组囊括了多组引物对,能够同时复制 DNA 的多个区域。用于扩增子测序的单个研究样本必须转化成文库,即借助第二次 PCR 扩增或接头连接,实现接头添加并增加靶向区域对应的各扩增子。接头使扩增子附着到流动槽或磁珠上以进行 NGS 测序。可对来自不同研究样本的扩增子进行合并(也叫作多重化),该过程是为样本添加条形码或标签序列,以便于在数据分析时对样本进行识别。接头可能包括标签序列,或者也可在 PCR 扩增步骤中添加标签。取决于文库中靶向测序扩增子,测序流动槽的一条泳道可以解析数百或数千个标签文库。
如图 1 中所示,xGen NGS 扩增子测序技术在单管中使用多个重叠的扩增子,通过一个快速、2 小时的流程来制备可直接上机测序的研究用文库。PCR1+PCR2 工作流程即使从低起始量 DNA 也可生成稳健的文库,随后可以使用传统方法进行定量和均一化,如 Qubit®(赛默飞世尔)或 Agilent Bioanalyzer®,或使用其中包含的 xGen Normalase™ 试剂进行均一化。
关键优势包括:
- 在单管 PCR 中扩增数百到数千的目标序列
- 适合用于低起始量样本,如游离 DNA (cfDNA)
- 支持高通量方法
- 可以针对多种研究应用进行设计,包括变异检测或靶向病原体测序
- 选用正确的接头和标签序列,即可兼容 Illumina® 测序平台